理事会为研究院的最高决策机构，负责研究院发展战略和学术方向的确定；年度项目计划和经费预算的审议；其他重大事项的决策以及研究院工作的监督等。
理事长：
吴晓灵 日博365官网手机版理事长、院长；第十二届全国人大常委、人大财经委 副主任委员；中国人民银行原副行长
理事：（按姓名拼音排序）
程建平 清华大学常务副校长
杜金富 中国银行业监督管理委员会纪委书记
潘功胜 中国人民银行党委委员、副行长
万建华 刘鸿儒金融教育基金会代表；国泰君安证券董事长
王兆星 中国银行业监督管理委员会副主席
谢维和 清华大学副校长
张志平 校友代表; 香港东英金融集团董事会主席周延礼 中国保险监督管理委员会副主席
庄心一 中国证券监督管理委员会副主席